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Plus de 90 pour cent du génome de la Turquie domestiques a été séquencé et assemblés. Des milliers de gènes jusque-là inconnues des scientifiques aviaire ont été décrites. Aussi d'intérêt sont les séquences des chromosomes sexuels «Z» et «W», qui ont été mal traités dans le passé.
US Department of Agriculture, d'autres

Un consortium international de chercheurs a réalisé la majorité de la séquence du génome de la dinde domestique, Merci en partie aux efforts des membres du corps professoral Virginia Tech.

L'équipe de recherche va publier "multi-plate-forme de séquençage nouvelle génération de la dinde domestique (Meleagris gallopavo): Génome Assemblée et de l'analyse» dans la revue PLoS Biology (Public Library of Science) le 7 septembre 2010.

«À ce jour, plus de 90 pour cent du génome de la Turquie domestiques a été séquencé et assemblés", a déclaré Rami Dalloul, professeur adjoint de sciences animales et avicoles dans un collège de Virginia Tech de l'agriculture et sciences de la vie. La majorité des données sont tirées des 10 plus grands chromosomes, appelée macrochromosomes, et les chercheurs du consortium sont toujours à la recherche du meilleur itinéraire pour séquencer le microchromosomes restants. "Nous avons déjà décrit des milliers de gènes jusque-là inconnues des scientifiques aviaire", a déclaré Dalloul.

Aussi d'intérêt sont les séquences des chromosomes sexuels «Z» et «W», qui ont été mal traités dans le passé.

En 2008, le consortium de recherche figurant à la carte du code génétique de la dinde domestique, le quatrième choix le plus populaire de la viande aux États-Unis. L'année suivante, Virginia Tech et l'Université du Minnesota a reçu de deux ans, accorder 900.000 dollars du ministère américain de l'agriculture pour compléter la séquence du génome, qui promet de nouvelles données pour les chercheurs aviaire et, finalement, un produit de meilleure qualité pour les producteurs de la Turquie et les consommateurs.

«À court terme, la séquence du génome permettra aux scientifiques de la connaissance des gènes spécifiques qui sont importantes dans le rendement en viande et de la qualité, la santé et la résistance aux maladies, la fertilité et la reproduction», a déclaré Dalloul. "Par exemple, nous ne savons pas toujours le mécanisme des interactions hôte-pathogène de travail, comment. La séquence du génome nous permettra de mieux comprendre ce processus, qui à son tour de nous donner une meilleure compréhension de la prévention des maladies et le traitement."

Selon Dalloul, la séquence du génome aura des avantages à long terme pour les producteurs de la Turquie. «Les producteurs de volailles peuvent être capables d'utiliser les connaissances que nous apporte la séquence du génome de croître plus rapidement les dindes et plus sain, et si elles peuvent produire les oiseaux de même taille dans un court laps de temps, ils peuvent aussi économiser de l'argent, dit-il. Une meilleure compréhension de la variation génétique chez cette espèce et des populations nicheuses mènera également au développement de nouveaux outils que les producteurs peuvent utiliser pour reproduire les dindes qui ont la texture souhaitable, la saveur et la maigreur, qui auront un impact direct des produits de consommation.

En outre, la séquence du génome peut avoir des applications dans le domaine biomédical. Ed Smith, professeur de sciences animales et avicoles à Virginia Tech, est une enquête sur une condition aviaire semblable à une cardiomyopathie dilatée chez l'homme. autres membres du consortium? Roger Coulombe à l'Université d'État de l'Utah et Kent Reed à l'Université du Minnesota? étudient les effets que les aflatoxines sont des dindes. Les aflatoxines sont des substances chimiques naturelles cancérigènes produites par des champignons qui affaiblissent le système immunitaire. La dinde domestiquée est l'espèce la plus sensible à l'aflatoxine connue.

Clive Evans, directeur de l'établissement de base de laboratoire à l'Institut Virginia Bioinformatics (VBI), a déclaré: «La disponibilité de la Roche GS FLX-technologie? Séquençage de titane à VBI permis au consortium de recherche de la Turquie à mettre en place rapidement et efficacement une première ébauche de la génome de la Turquie. " Ce projet a été étendu en 2009 avec les données de la plate-forme de séquençage Illumina au Service de l'USDA-recherche agricole et assemblés par des scientifiques de l'Université du Maryland afin de produire de l'Assemblée actuelle génome. L'utilisation de ces technologies de séquençage nouvelle génération à condition que la Turquie l'assemblage de séquences du génome à une fraction du coût de production d'une poule rouge assemblage du génome (la même espèce que le poulet domestique) en 2004.

Le consortium international a passé l'année dernière annotation et l'analyse du projet de séquençage du génome, qui a abouti à «étoffer les subtilités de la génétique de la Turquie, le projet tel qu'il est décrit en détail dans le document de biologie de PLoS," a dit Evans. L'équipe de recherche espère l'approche intégrée utilisée pour obtenir le génome de la Turquie constituera un modèle pour créer des gènes et des chromosomes au niveau des assemblées pour d'autres espèces d'importance agricole, écologique ou évolutif.