Bioinformatics - Bio-informatique Nouvelles

Voici quelques conseils histoire de l'US Department of Energy's Oak Ridge National Laboratory pour août 2010.

Pour obtenir une entrevue avec un chercheur, s'il vous plaît contacter le service communication externe et membre du personnel des relations identifiées à la fin de chaque pointe. Pour plus d'informations sur ORNL et ses activités de recherche et de développement, s'il vous plaît se référer à l'un de nos contacts avec les médias. Si vous avez une question concernant les médias généraux ou commentaire, vous pouvez l'envoyer à Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. &rurl=translate.google.com&usg=ALkJrhhgTMQtheYz0jtWamMg9J4QlgEgDw> Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. .

INFORMATIQUE - Bugs Battling. . .

Les erreurs de logiciels d'écriture connue sous le nom de "bugs" peuvent être une douleur, même pour les applications simples, ce qui oblige les développeurs à passer par leur code ligne par ligne pour trouver et corriger les erreurs. Ces bugs sont beaucoup plus graves lorsque les applications sont écrites pour les superordinateurs les plus puissants du monde, que les principales applications scientifiques peuvent être des dizaines de milliers de lignes de long et courir sur des centaines de milliers de processeurs simultanément. En réponse, une collaboration entre Oak Ridge National Laboratory (ORNL) et le logiciel outilleur Allinea Software a produit une arme redoutable dans la lutte contre les insectes demande. Quand il est sorti cet été, Allinea DDT permettra aux programmeurs d'analyser les applications en cours d'exécution 220.000 processus simultanés et d'identifier les problèmes à mesure qu'ils surviennent. "Ce projet signifie que les développeurs d'application ont une chance de déboguer leur code dans un délai raisonnable à l'échelle», a déclaré ORNL Application Performance Tools Group leader Richard Graham. «Ils n'auront pas à écrire du code pour déboguer cas particulier des choses, et passer par le processus de débogage du code de débogage. Il vous permet d'obtenir des informations selon lesquelles de beaucoup de temps pour obtenir au contraire." [Contact: Leo Williams, (865) 574-8891; Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. &rurl=translate.google.com&usg=ALkJrhgyOxn8r-fqLD1kn2vqkON2BVAMAQ> Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. ]

DATA - L'observation des oiseaux par satellite. . .

En utilisant un outil d'analyse de données développé à Oak Ridge National Laboratory, les satellites peuvent aider les chercheurs étudient les oiseaux volent dans votre cour. Des scientifiques de ORNL Distributed Active Archive Center, ou DAAC, collaborent avec des chercheurs de l'Université Cornell à travers un projet appelé DataOne (Réseau d'observation de la Terre) afin de permettre l'analyse avancée de la distribution des espèces d'oiseaux et les schémas de migration. L'outil permet à l'ORNL enquêteurs Cornell pour extraire des données spécifiques générées par le capteur MODIS de la NASA par satellite et de l'associer à des observations sur le terrain archivées dans la base de données eBird Cornell. "La combinaison des données par satellite avec les observations d'oiseaux est une nouveauté", a déclaré Suresh Santhana Vannan, un scientifique ORNL DAAC. «Ils sont normalement de deux domaines de recherche distincts." En incorporant des données extraites de MODIS tels que l'indice de densité de végétation normalisé, ou «écologique» de la région, les chercheurs peuvent mener des analyses plus complexes, telles que la modélisation comment les variations dans la végétation liées au changement climatique peut affecter la migration des oiseaux. [Contact: Morgan McCorkle, (865) 574-7308; Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. &rurl=translate.google.com&usg=ALkJrhi7rroIIyJp4R97dg7RaHilN_2JAA> Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. ]

SOINS DE SANTÉ - La force du nombre. . .

Les progrès médicaux réalisés dans les laboratoires et les paramètres cliniques pourrait atteindre les patients plus tôt en raison d'une subvention de 38 millions de dollars de la National Institutes of Health à neuf institutions. ordinateurs les plus puissants du monde, à Oak Ridge National Laboratory jouera un rôle dans l'effort, de même que les capacités de laboratoire dans les nanotechnologies, la génétique et la science des particules. Grâce à un partenariat avec les Universités de Georgetown-Howard Center for Science clinique et translationnelle, la tâche ORNL est d'offrir l'occasion inégalée à haute vitesse, de l'informatique à haut volume de développer de nouvelles méthodologies de translation dans la découverte de médicaments et les interactions génome-environnement. Les fonds ont été attribués dans le cadre de la clinique et translationnelle Science Programme de bourses (www.CTSAweb.org). [Contact: Ron Walli, (865) 576-0226; Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. &rurl=translate.google.com&usg=ALkJrhjcdr2N_QzTCIDsE3eFHdiiwDL2GA> Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. ]

PHYSIQUE - nucléon comportement surprenant. . .

Les données du DOE's Oak Ridge National Laboratory sur les interactions des neutrons avec des isotopes de platine en contradiction avec une hypothèse de base qui sous-tend la théorie des matrices aléatoires, les modèles de la physique nucléaire et du chaos quantique. Depuis plus d'un demi-siècle, les scientifiques ont supposé que des états hautement excités dans intermédiaires à noyaux lourds de masse sont chaotiques, et que les données appui de cette hypothèse. Toutefois, de nouvelles données de l'Oak Ridge électrons de l'accélérateur linéaire fortement en désaccord. Les nouveaux résultats suggèrent que les quelque 200 nucléons dans le noyau de platine a étudié à l'unisson pour exposition régulière plutôt que des propriétés chaotiques. Compte tenu de l'énergie relativement élevée et un grand nombre de nucléons concernés, tels le comportement collectif est tout à fait inattendu et inexpliqué. Une explication possible est que le principe encore plus fondamental de la théorie - quelque chose de connu comme l'invariance forme - est violé. «De toute façon, que ces hypothèses sous-tendent le modèle nucléaire statistiques, l'impact de ces nouveaux résultats pourraient être très large tout au long de la physique nucléaire, astrophysique nucléaire et dans des applications telles que l'énergie nucléaire", a déclaré ORNL physicien Paul Koehler. [Contact: Bill Cabage, (865) 574-4399, Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. &rurl=translate.google.com&usg=ALkJrhiCKM6QIqrpwDS1nQLztgNN-9znFg> Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. ]

RÉPARATION DE L'ADN - machines moléculaires. . .

Ivaylo Ivanov de Georgia State University et ses collègues ont utilisé Jaguar http://www.nccs.gov/computing-resources/jaguar/, un système Cray XT calcul de haute performance à Oak Ridge National Laboratory, pour élucider le mécanisme par lequel les protéines accessoire appelé pinces coulissantes sont chargés sur des brins d'ADN et de coordonner les enzymes qui permettent la réparation des gènes ou la réplication. «Cette recherche a une incidence directe sur la compréhension des bases moléculaires de l'intégrité génétique et la perte de cette intégrité dans le cancer et les maladies dégénératives», dit M. Ivanov, dont le travail est apparu dans un numéro récent du Journal de l'American Chemical Society. Bien que chargeuses pince de différents royaumes de la vie (bactéries, virus, animaux, etc) partagent de nombreuses caractéristiques architecturales, elles diffèrent de façon mécanique. Médicaments ciblés pour le chargeur de serre pourrait inhiber sélectivement la réplication de l'ADN viral dans les maladies comme la varicelle, l'herpès et le SIDA sans interférer avec la réplication de l'ADN dans les cellules humaines normales. De même, dans les processus de réplication de l'ADN a augmenté, comme le cancer, le chargement de serrage inhibition pourrait produire des effets thérapeutiques sans effets secondaires indésirables. [Contact: Dawn Levy, (865) 576-6448; Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. &rurl=translate.google.com&usg=ALkJrhjj4sdeuCy_8gLchqr0KlMgcJ6jcA> Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. ]